MEGA 5.0构建进化树
分子生物学研究中经常会遇到构建基因进化树,现在分享一下如何用MEGA5.0构建分子进化树
操作方法
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新建一个TXT格式的文档
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打开文档,把需要构建分子进化树的基因序列的FASTA格式序列复制粘贴到TXT文档中,并保存。
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将文本文档的后缀“TXT”更改为“fasta”,如下图所示。
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双击fasta文件,由MEGA5.0打开,如图
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单击W图标中的“Align DNA”,会提醒你选择序列,单击确定即可,如下图
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比对后的序列如下图。
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然后我们需要把“*”号之外的序列全部删除,只留下"*"标注的序列,保存一下
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关闭小窗口,回到MEGA5.0的主界面,单击“phylogeny”的下拉符合,选择“Construct/Test Neighbor-Joining Tree...“,选择刚才保存的文档。
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打开之后按照默认参数点击确定即可运行,最后得到进化树如图所示。
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